يعتمد علم الجينوم الحسابي علي المعلوماتية الحيوية. وخلال فتره الستينيات ، طورت مارجريت دايهوف وآخرون في المؤسسة الوطنية للبحوث الطبية الحيوية مستودعًا لبروتينات مماثلة لدراسة التطور. أنتج بحثه قيمة نسجية وحدد الطفرات التي تتطلب نوعًا واحدًا من البروتين للتغيير من نوع إلى آخر بناءً على الأحماض الأمينية الأصلية. قادهم ذلك إلى إنشاء حاسبة مصفوفة تحسب قدرة بروتين واحد على التفاعل مع الآخر.
في أوائل الثمانينيات ، بدأ تسجيل مخازن الجينوم المتتالية ، لكن هذا أدى إلى تحديات جديدة في عملية البحث ومقارنة المحفوظات بالمعلومات الجينية. على عكس خوارزميات محرك البحث المستخدمة في صفحات مثل Google أو Wikipedia ، فإن البحث عن مجموعات جينية مماثلة لا يتطلب معرفًا واحدًا ، ولكن يتطلب فئات متشابهة. أدى ذلك إلى تطوير خوارزمية Needleman-Wunsch ، وهي طريقة معدلة لمطابقة مجموعات الأحماض الأمينية المتعاقبة باستخدام المصفوفات المشتقة من بحث Daihoff الأصلي. في الآونة الأخيرة ، تم تطوير خوارزمية BLAST لتتبع استنفاد الجينات بسرعة وكفاءة. من المحتمل أن تكون BLAST ومخرجاتها هي الأكثر استخدامًا لهذه الأسباب.
ارتبط ظهور مصطلح "الجينوم الحاسوبي" باكتش
اف الجينومات المتعاقبة في التسعينيات. تم تنظيم المؤتمر السنوي الأول لمؤتمر علم الجينوم الحاسوبي من قبل علماء من معهد أبحاث الجينوم (TIGR) في عام 1998 ، ونظم الندوة وميز قسم العلوم من جميع أقسام علم الجينوم أو علم الأحياء الحسابي. . ] في العام الماضي في دراسة الحمض النووي كان أول استخدام للمصطلح في المؤلفات العلمية - تحليلات المنشورات الطبية على الإنترنت وملخصات نظام الاسترجاع. عُقد المؤتمر الأخير حول قراءة الجينوم في عام 2006 ، عندما لفتت المناقشة انتباه الحائز على جائزة نوبل باري مارشال ، حيث وجد شريكًا في هيليكوباكتر بيلوري وقرحة الجهاز الهضمي. منذ عام 2010 ، تضمنت المؤتمرات الصناعية الرائدة الأنظمة البيولوجية (أنظمة البيولوجيا الذكية) ، وأبحاث البيولوجيا المحوسبة ، ومختبر كولد سبرينغ هاربور ، ومؤتمرات معهد سانجر المسماة "علم الأحياء الجينومي" و "المعلومات الجينية".
ونتيجة لذلك ، فإن تطوير الرياضيات بمساعدة الكمبيوتر (باستخدام مواد مثل Mathematica أو Matlab) قد مكّن المهندسين وعلماء الرياضيات وعلماء الكمبيوتر من العمل في هذا المجال وبالتالي إنشاء نظام إثبات عالمي وإثبات عالمي. قصة البداية. ودفع. مقارنات الجينوم في تحليل التعبير الجيني [8] أدى ذلك إلى زيادة سريعة في إيصال مجموعة متنوعة من الأفكار ، بما في ذلك النظم والمفاهيم المعرفية والمعالجة المعرفية وتحليل الخيوط واستخراج البيانات. تشمل التطورات الحديثة في تحليل الجينوم (2012) عينات الحمض النووي المستخدمة لترجمة محتوى الحمض النووي إلى التشفير. من المتوقع أن يظل التدريب على الكمبيوتر موضوعًا أساسيًا في البحث والتدريس ، حيث بدأ الطلاب الحاليون في كلا الدورتين في تدريس مجموعة من الدورات التي تم تطويرها في السنوات الأخيرة.
تعليقات
إرسال تعليق